(六) 参与编制国家重大科学工程等科技基地的建设规划；编制和实施国家重点实验室等科技基地的计划。
(七) 研究科技人才资源的合理配置，提出充分发挥科技人员积极性、创造科技人才成长良好环境的相关政策。
(八) 研究制订我国对外科技合作与交流的方针、政策；负责双边和多边政府及有关国际组织之间的科技合作计划；指导驻外科技机构的工作；负责驻外使领馆科技干部的选派与管理；管理外国政府、国际科技组织有关对华科技援助和我国对外科技援助的工作；负责与香港特别行政区及澳门、台湾地区的科技合作与交流工作。
(九) 研究提出制订科技法律、法规的建议；归口管理全国科技成果、科技奖励、科技保密、技术市场、与科技相关的知识产权保护等工作；制定科学技术普及工作规划，实行政策引导，推动科普工作发展；促进科技咨询、招标、评估等社会中介组织的发展，推动科技服务体系的建立。
(十) 负责科技信息、科技统计和科技期刊管理工作；审核科研机构的组建和调整。
(十一) 指导协调国务院各部门和各省、自治区、直辖市的科技管理工作。
(十二) 代管科技日报社。
(十三) 承担国家科技教育领导小组交办的有关工作。
(十四) 承办国务院交办的其他事项。
二、内设机构和职能
(一) 办 公 厅
承办国家科技教育领导小组交办的有关工作；负责有关重要文件起草、调研工作；负责会议组织、文电处理、秘书事务、文书档案管理和信访、保密等政务工作；负责科技宣传和新闻发布工作。围绕部中心工作，开展软科学研究。
(二) 人 事 司
按照干部管理权限，负责部机关及直属单位的干部队伍建设和有关人事、机构编制工作；负责驻外科技干部的选派与管理等工作。
(三) 政策法规与体制改革司
研究全国科技工作、科技与经济结合的方针和政策，创造有利于科技成果转化的环境；组织研究科技体制改革的总体规划和政策措施，指导、推动部门和地方科研院所的体制改革工作；研究起草有关科技法律、法规，研究提出加强有关科技知识产权保护、技术合同仲裁、科技咨询等工作的政策措施；研究科技人员有关政策，推动科技管理干部培训及科普工作；对科研机构的组建和调整进行审核。
(四) 发展计划司
研究科技发展战略，组织编制中长期科技发展规划；组织编制国家各项科技发展计划、科技开发计划指南和国家工程中心等科技基地组建计划；提出国家各项科技计划的协调、综合平衡和经费配置的建议。研究提出科技成果登记、评价、鉴定、奖励、保密、技术市场、技术出口等政策、条例和管理办法；参与编制国家重大科学工程的建设规划；管理国家级高新技术重点新产品工作；负责科技统计工作。
(五) 条件财务司
研究多渠道增加科技投入的政策措施，负责开辟科技经费渠道、筹措科技资金；负责编制归口管理的科学事业费、科技“三项费”和科技外事经费等有关费用的预、决算；推动科技经费的财务改革和财务会计制度的实施工作，对经费的使用管理进行监督；研究科研条件保障方面的方针、政策和规划；负责科技期刊管理工作；编制和管理机关基建计划；监管直属单位的国有资产。
(六) 国际合作司
研究国际科技合作的方针、政策及有关规章、制度；组织实施政府双边和多边及有关国际组织之间的科技合作计划、官方科技合作协议等外事工作，审核与协调重要民间科技合作交流项目；组织实施外国政府、国际组织有关对华科技援助和我国对外科技援助；指导驻外科技机构工作，联系外国政府和国际组织的驻华科技机构，联系对香港、澳门特别行政区及台湾有关科技工作。
(七) 基础研究司
研究国家基础研究的发展战略、方针和政策；组织提出国家重点基础研究发展规划、实施基础研究重大项目前期研究专项；组织推荐和实施国家重大科学工程及重点基础研究基地建设；规划并指导国家重点实验室的建设；推动基础研究机构的科技体制改革工作；承办基础研究的有关工作。
(八) 高新技术发展及产业化司
研究工业领域高新技术发展及产业化的方针政策；组织提出工业领域高新技术发展规划和计划；组织实施信息、自动化、能源和新材料等领域高新技术研究发展计划；组织实施工业领域国家重大科技攻关计划和科技创新工程；承担国家级高新技术产业开发区及科技企业孵化器的宏观管理工作；推动工业领域的科技体制改革工作和生产力促进中心等技术服务体系的建设。
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