恩格斯曾经指出，科学在两门学科之间的交界处，是最有前途的。在新时期条件下，国内外形势的复杂性和我们所处的时代的新特征，决定了许多重大问题的研究方法必然是跨学科交叉研究性质的。研究方法的创新是理论创新的一个重要内涵，只有在思维模式上保持与时俱进，不断吸纳新知识、新方法，才能取得创新的成功，将一些重大前沿理论问题，以跨学科的态度推向理论研究的新空间。由于党风科学是以党风建设为研究对象的多学科交叉的综合性应用科学，并具有重大的时代价值，因此，它的研究方法也具有多学科交叉的特点。除了普遍联系的方法和科学抽象的方法外，还有其它一些具体方法，比如：逻辑方法、社会调查研究方法、典型实验法、统计方法、历史考察方法、总结式研究方法、专题式研究方法、归纳式研究方法、综合式研究方法、层次式研究方法、动态式研究方法，以及系统论、控制论、信息论等软科学的一些研究方法。这些方法是打开党风科学之门的钥匙，是完善和发展党风科学的手段。只有正确地掌握和运用这些方法，才能达到党风科学研究的目的，找到这门学科的真谛，使党风科学更好地为加强执政党的党风建设服务。党风科学经过几年的发展，初步确定了它在科学群体中的应有的地位，党风建设是否可以作为一门科学来研究的问题已经解决。现在摆在我们面前的一个重要任务是总结党风科学研究已经取得的成果，使我们对党风问题的认识进一步科学化、理论化、系统化，完善党风科学的理论体系，推动党风科学研究向纵深发展。
在人类的认识发展史上，始终存在着分析与综合的运动。当人类认识脱离直观状态进入真正的科学研究领域，首先必须对事物和现象进行分析，从而占有关于事物各个部分及其诸方面的详尽知识。然而，分析能够为科学大厦的建构提供材料，但还不是这个大厦本身。要对事物进行既全面又深刻的理解，就必须从“搜集材料的科学，关于既成事物的科学”（马克思恩格斯选集）第卷，第页），进入到“整理材料的科学，关于过程、关于这些事物的发生和发展以及关于把这些自然过程结合为一个伟大整体的联系的科学。”这就是辩证的综合。科学的发展总是从分析到综合再到分析的反复无穷的过程。党风科学的发展也同样是分析与综合的辩证统一。如果党风科学不仅仅满足于对整体现象作出一般性的结论，那就需要对党风现象的整体进行分析，即对党风向题的各个方面分门别类地加以详细的研究。在这方面，我们的理论工作者已经取得了相当可观的研究成果。但是要想使党风科学真正成为一门科学，还必须做综合工作，深入思考各个分支体系的内在联系，使其形成一个党风科学的总体系，这就必须下大功夫，组织全国力量进行综合性的科学研究，形成一个对党风向题的各个侧重面的研究具有一般指导意义的科学理论体系，从而把党风科学研究推向一个新阶段。
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