从关系到乡镇财政收入和支出的两项改革来看，恐怕目前都不足以应对乡镇财政所面临的危机，甚至税费改革还在一定程度上加重了乡镇政府的财政危机的压力。那么乡镇财政危机的根源在哪里，到底应该如何应对这种局面呢？
三、乡镇政府财政危机产生的原因
已经有很多学者和政策研究人员开始关注乡镇政府的财政危机问题，对于目前乡镇政府产生财政危机的原因很多人都有很详细的讨论，并且他们分析的原因都有很强的共识性。总结起来看，人们分析乡镇政府财政危机的原因主要有以下一些方面：
机构臃肿，人员膨胀
根据的有关法律和制度，乡镇政府是农村地区最基层的政府，其机构设置不要求与上级政府的部门相对应进行对口设置，因而它同时也是机构设置最简单的一级政府。但是法律对于乡镇政府机构设置的审批程序却没有严格的规定，造成机构设置随意性大，机构和人员不断膨胀，使得干部工资和公务费开支巨大。大量的调查研究都证实了这一点。如据国家统计局年对个小城镇的调查，每个镇的机构一般都在个，其中镇属机构的干部人数平均为名，上级政府派出机构的干部人数为名，都超出编制人数的数倍。何开荫对安徽乡镇的调查也表明，乡镇党委和政府的公务人员便有个，如果加上勤杂人员会达到多人。其他很多人的研究都支持这个分析，如孙自铎、钱建凯、王安仁等人和四川省农村社会经济调查队等，都认为机构臃肿、人员膨胀是造成乡镇政府财政问题的一个重要原因。
管理混乱，干部腐败
财务管理混乱和干部腐败也是造成乡镇财政负担重的原因之一。乡镇一级政府普遍缺乏预算意识，财政支出管理漏洞较多，不少乡镇不仅多个部门和领导有财务审批权，而且存在滥购、滥补、滥奖的现象。同时，乡镇干部的贪污腐败、大吃大喝现象也并不少见，如据这几年新闻媒体的公开报道，仅由于乡镇干部赊账吃饭而使饭店酒楼破产倒闭的至少就有十起上下。因此，许多研究者都把这一点列为形成乡镇政府财政危机的原因之一，如上述孙自铎、钱建凯、王安仁等人的研究中都有这一认识。当然，不用多说，人员过多和干部腐败不仅加重了乡镇政府的财政负担，而且也必然要加重农民负担，引起农民的不满以及农民和干部的冲突。
升级达标，开支巨大
从世纪年代初以来，各级政府经常举行大大小小的名目繁多的达标升级活动，象“普六”、“普九”、教育“双基”达标、卫生“初保”达标、计生服务站达标、油路乡乡通、订报、灭鼠、卫生室、改水、改厕、各类活动室达标等等。这些活动每一项达标验收都要花费不少钱财、动用很多民力，而它们最终都要沉淀到乡镇，由乡镇政府具体落实。乡镇政府明知这些活动劳民伤财，乡镇财政无此实力，但是在政绩考核“一票否决”的压力下不得不“打肿脸充胖子”，硬着头皮去完成这些达标项目，一方面加重了农民负担，另一方面也加重了乡镇财政负担。
分税不公，职责过重
年以来实行的分税制存在着收入向上集中、支出向下转移的制度性缺陷。在分税制下，重要税种的收入有的全部归属中央，有的在中央与地方、或地方各级政府间分成。地方各级政府为了保障各自的财政收入，往往采取层层下压的办法，尽可能地从下级政府那里获取更多的分成。甚至，上级政府每年下达给乡镇政府的财税收入计划还可能脱离乡镇实际，使乡镇政府根本无法完成。但是由于把财政收入完成情况与乡镇主要领导和分管领导的政绩考核挂钩，完不成任务便“一票否决”，甚至就地免职，迫使乡镇政府为完成计划弄虚作假，拼命举债。
同时，由于分税制只解决了税收的划分问题，而对各级政府应该承担的职责划分却不甚明了。这就导致上级政府尽可能地通过职责下移的办法将财政支出转移给下级政府，而乡镇政府作为最底层的一级政府没有再转移的余地，只好默默承受着这不公平的职责转移。换句话说，乡镇政府在税收分成中分得的是最没有保障的小块份额，但是却要承担本应由中央政府或其他上级政府应该的职责，如农村的卫生、教育、道路、水利、电力等公共事业和基础设施建设，现在基本上是由基层政府来承担。别的不说，单就九年义务教育而论，在城市地区是由国家负担，而在农村地区校舍建设、教师工资都要由乡镇财政解决，乡镇政府对此实在是难以承受。因此有人将分税制后各级政府间财政状况总结为四句话：“中央财政很好过，省级财政也好过，地市级财政可以过，县乡两级真难过。”当然，为了完成这些职责，乡镇政府只好或者大举借债，或者向农民转嫁负担。
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